原核生物全基因组中16s rRNA基因序列的识别方法

16s rRNA基因约1.5kb左右，大小合适，含有高度保守的片段，同时在不同的菌株间也含有变异的片段。既能体现相同菌种之间的相似性，又能体现不同菌种之间的差异性；此基因序列，既满足细菌种内是保守的，又能满足种间是特异的，因此是常用于细菌分类与鉴定的分子标记。 现在一般使用16s rRNA基因的通用引物从总DNA中扩增得到16s rRNA序列，再经测序获取其序列信息。此模型通过一系列序列分析算法，构建出识别16s rRNA基因序列的模型。此模型可以用于16s rRNA基因序列预筛选，发现未知的16s rRNA基因序列，以及对前者的实验结果进行校正等。